柯南和小五郎等拉着大队，来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古已有流传，大概有关沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”，及300年前两名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧流传，在“海底宫殿”附近潜水时，意外遇到一大群正在寻找宝物的猎人，不料其中一人突然遭鲨鱼攻击，不幸身亡！小兰和园子幸运逃难，柯南见那位猎人死状诡异，与灰原一起展开调查。 柯南认为猎人之死，跟宝藏传说有着莫大关系，他试图解开背后原因，“海底宫殿”的谜题一直系绕在他的脑海中。他找到了一组神秘名词“Jolly Roger(海盗旗)”后，满以为有所起色，猎人却突然现身，并偷走了原来发现的宝藏！小兰和园子落在猎人的魔掌之中，性命危在旦夕！隐藏于传说中的讯息是什么？“海底宫殿”有什么秘密？穿越300年时光的暗号，柯南誓要逐步解开迷题
演员：罗伯·施奈德 海瑟·格拉汉姆 郑肯 科尔姆·米尼 洛雷塔·迪瓦恩 加布里埃尔·伊格莱西亚斯 迈克尔·麦克埃尔哈顿 比尔·奈伊 杰斯·哈梅尔 扎克瑞·戈登 查尔斯·阿德勒 珍妮特·瓦尼 基思·弗格森 黛比·德里贝里 莎乐美·延斯
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演员：真田广之 石田太郎 小山茉美 富山崇士 江幡高志 羽佐间道夫 池田昌子 堀江美都子 山本百合子 永井一郎 青野武 柴田秀胜 家弓家正 天草四郎 曾我部和行 盐泽兼人 杉元直树 寺岛干夫 北村弘一 村松康雄 田中康郎 朝井良江 铃木富子 田中亮一 平野正人 田中和实 冈和男 福永荣一 远藤浩 江森浩子 菊地英博 高柳润 金丸祐一 谷口奈绪子 林英哲
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